在李幼滋这个工部尚书积极负责官邸的设计与建造期间，少师兼五军都督府知枢密院事方逢时也已完成了对枢密院的组建工作，初步订立了枢密院与兵部各自在军事上的分工，也建立了初步的枢密院相应政务的运行制度。

  本来是在兵部下辖兵政院进行学习的原贵州巡抚江一麟、云南左布政使金学曾、安庆知府叶梦熊等，直接就因此被方逢时奏请得皇帝同意而提前毕业，直接到枢密院任职；

  而且，本是在后军都督府任佥书负责训练兵车营与在京卫武学负责训练武将的俞大猷，也被方逢时奏请得皇帝同意，以枢密副使的身份在枢密院任职；

  另外，方逢时还从兵部抽调了一些人，以此，组建起了枢密院的基本框架。

  因为枢密院是五军都督府下辖掌军机之处，故而方逢时就以此为由，吸纳了武将俞大猷进入枢密院体系，参与武臣铨叙。

  而方逢时让俞大猷进入枢密院，既是因为他同张居正一样重视武将，也因为他知道俞大猷在浙江打过仗，还任过浙江总